O fatsort é uma ferramenta de linha de comando que pode organizar a estrutura de diretórios de um sistema de arquivos FAT16 ou FAT32. Ele pode ser usado para organizar os arquivos e diretórios em um drive USB, cartão SD ou outro dispositivo de armazenamento que usa um sistema de arquivos FAT. O fatsort também pode ser usado para consertar problemas causados por estruturas de diretórios desorganizadas, como arquivos que não podem ser encontrados ou excluídos. 